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乐鱼生物拥有多种平台,在科研范畴的使用非常普遍,包罗人、动动物、微生物等天然界物种的基因组测序(基因组de novo测序、基因组重测序)、转录组测序(RNA-Seq、miRNA-Seq、lncRNA-Seq等)、外显子组测序、目的地区捕捉测序、表观组测序(ChIP-Seq、全基因组甲基化测序等)、16S测序、宏基因组测序、宏转录组测序等等。
全基因组测序
全基因组测序是对未知基因组序列的物种举行个别的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人类基因组测序的迷信家之一。他以为假如可以晓得一切人类基因的序列,对癌症的研讨将会很有协助。美国动力部(DOE)与美国国度卫生研讨院(NIH),辨别在1986年与1987年参加人类基因组方案。除了美国之外,日本在1981年就曾经开端研讨相干题目,但并没有美国那样正。到了1988年,詹姆士·华生(DNA双螺旋布局发明者之一)成为NIH的基因组部分主管。1990年开端国际互助。1996年,多个国度召开百慕达集会,以2005年完成测序为目的,分派了列国卖力的事情,而且宣布研讨后果将会实时发布,并完全收费。
转录组测序
转录组(transcriptome)狭义上指某终身理条件下,细胞内一切转录产品的聚集,包罗信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;广义上指一切mRNA的聚集。卵白质是利用细胞功效的次要承当者,卵白质组是细胞功效和形态的最间接形貌,转录构成为研讨基因表达的次要手腕,转录组是毗连基因组遗传信息与生物功效的卵白质组的一定纽带,转录程度的调控是现在研讨最多的,也是生物体最紧张的调控方法。
外显子组测序
也称目的外显子组捕捉,是指使用序列捕捉技能将全基因组外显子地区DNA捕获并富集落伍行高通量测序的基因组剖析办法。是一种选择基因组的编码序列的高效战略,外显子测序绝对于基因组重测序本钱较低,对研讨已知基因的SNP、Indel等具有较大的上风。
外显子(expressed region)是真核生物基因的一局部,它在剪接(Splicing)后仍会被保管上去,并可在卵白质生物分解历程中被表达为卵白质。外显子是最初呈现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最后的转录产品中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。在人类基因中约莫有180,000外显子,占人类基因组的1%,约30MB。
外显子组测序是确定稀有的孟德尔遗传疾病的因果变革高效战略。
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